Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
AcanQ61282 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AcanQ61282 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AcanQ61282 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AcanQ61282 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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