Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna1Q60960 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna1Q60960 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms