Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf3Q60803 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms