Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2dQ60773 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2dQ60773 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms