Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprnQ60673 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprnQ60673 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms