Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NotoQ5TIS6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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NotoQ5TIS6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NotoQ5TIS6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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NotoQ5TIS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NotoQ5TIS6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NotoQ5TIS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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