Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsr1Q5SWD9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms