Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znrf3Q5SSZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znrf3Q5SSZ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znrf3Q5SSZ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms