Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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