Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmprss11eQ5S248 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmprss11eQ5S248 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms