Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms