Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms