Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otol1Q4ZJM7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otol1Q4ZJM7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms