Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc3lQ4KL14 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms