Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms