Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam220aQ3ZN08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Fam220aQ3ZN08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam220aQ3ZN08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam220aQ3ZN08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Fam220aQ3ZN08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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