Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm28047Q3US59 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm28047Q3US59 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms