Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms