Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LchnQ3UHG7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LchnQ3UHG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms