Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mier3Q3UHF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mier3Q3UHF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms