Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp36Q3UFY0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms