Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd33bQ3U0L2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms