Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccndbp1Q3TVC7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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