Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ccdc136Q3TVA9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc136Q3TVA9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms