Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21440Q3TTD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21440Q3TTD8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms