Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc13Q3TIR1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms