Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm1123Q1RME4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms