Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP5Q15291 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP5Q15291 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms