Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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