Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
StumQ0VBF8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
StumQ0VBF8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms