Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tmem52bQ0VBF2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms