Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab42Q0PD08 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms