Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms