Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms