Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdx4Q07424 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms