Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms