Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Caprin2Q05A80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms