Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Fmn1Q05860 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fmn1Q05860 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms