Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms