Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxcr5Q04683 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms