Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms