Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mmp11Q02853 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mmp11Q02853 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mmp11Q02853 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mmp11Q02853 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mmp11Q02853 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms