Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nucb1Q02819 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nucb1Q02819 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms