Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfiaQ02780 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms