Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax5Q02650 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms