Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ank1Q02357 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ank1Q02357 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms