Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms