Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms