Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx1P82976 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx1P82976 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms