Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ldb1P70662 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms